MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 22098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017291	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453057
2	NC_017291	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453057
3	NC_017291	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453057
4	NC_017291	T	7	7	256	262	0 %	100 %	0 %	0 %	384453057
5	NC_017291	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	384453057
6	NC_017291	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	384453057
7	NC_017291	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	384453057
8	NC_017291	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453057
9	NC_017291	A	7	7	478	484	100 %	0 %	0 %	0 %	384453057
10	NC_017291	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	384453057
11	NC_017291	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453057
12	NC_017291	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453057
13	NC_017291	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	384453057
14	NC_017291	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453057
15	NC_017291	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453057
16	NC_017291	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	384453057
17	NC_017291	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453057
18	NC_017291	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453057
19	NC_017291	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453057
20	NC_017291	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453057
21	NC_017291	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453057
22	NC_017291	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453057
23	NC_017291	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453057
24	NC_017291	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
25	NC_017291	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	384453058
26	NC_017291	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	384453058
27	NC_017291	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453058
28	NC_017291	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
29	NC_017291	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	384453058
30	NC_017291	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453058
31	NC_017291	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
32	NC_017291	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	384453058
33	NC_017291	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
34	NC_017291	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453058
35	NC_017291	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
36	NC_017291	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	384453058
37	NC_017291	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453058
38	NC_017291	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
39	NC_017291	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453058
40	NC_017291	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
41	NC_017291	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
42	NC_017291	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453058
43	NC_017291	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
44	NC_017291	T	6	6	2210	2215	0 %	100 %	0 %	0 %	384453058
45	NC_017291	T	8	8	2289	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	384453058
46	NC_017291	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453058
47	NC_017291	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453058
48	NC_017291	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	384453058
49	NC_017291	T	8	8	2617	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	384453059
50	NC_017291	T	8	8	2629	2636	0 %	100 %	0 %	0 %	384453059
51	NC_017291	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453059
52	NC_017291	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
53	NC_017291	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453059
54	NC_017291	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	384453059
55	NC_017291	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453059
56	NC_017291	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	384453059
57	NC_017291	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
58	NC_017291	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	384453059
59	NC_017291	T	6	6	2885	2890	0 %	100 %	0 %	0 %	384453059
60	NC_017291	T	6	6	2897	2902	0 %	100 %	0 %	0 %	384453059
61	NC_017291	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453059
62	NC_017291	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	384453059
63	NC_017291	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
64	NC_017291	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	384453059
65	NC_017291	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
66	NC_017291	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	384453059
67	NC_017291	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
68	NC_017291	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	384453060
69	NC_017291	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	384453060
70	NC_017291	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	384453060
71	NC_017291	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	384453060
72	NC_017291	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
73	NC_017291	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
74	NC_017291	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453060
75	NC_017291	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453060
76	NC_017291	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
77	NC_017291	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453060
78	NC_017291	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453060
79	NC_017291	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
80	NC_017291	T	6	6	4191	4196	0 %	100 %	0 %	0 %	384453060
81	NC_017291	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453060
82	NC_017291	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	384453060
83	NC_017291	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
84	NC_017291	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453060
85	NC_017291	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453060
86	NC_017291	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	384453060
87	NC_017291	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
88	NC_017291	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453060
89	NC_017291	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
90	NC_017291	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
91	NC_017291	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453060
92	NC_017291	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	384453060
93	NC_017291	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
94	NC_017291	CTGTGG	2	12	4820	4831	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384453060
95	NC_017291	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
96	NC_017291	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453060
97	NC_017291	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
98	NC_017291	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
99	NC_017291	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453060
100	NC_017291	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453060
101	NC_017291	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	384453060
102	NC_017291	T	7	7	5457	5463	0 %	100 %	0 %	0 %	384453061
103	NC_017291	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453061
104	NC_017291	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	384453061
105	NC_017291	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453061
106	NC_017291	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453061
107	NC_017291	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
108	NC_017291	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
109	NC_017291	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
110	NC_017291	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
111	NC_017291	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453061
112	NC_017291	T	6	6	5786	5791	0 %	100 %	0 %	0 %	384453061
113	NC_017291	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
114	NC_017291	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
115	NC_017291	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
116	NC_017291	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
117	NC_017291	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
118	NC_017291	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453061
119	NC_017291	T	7	7	6072	6078	0 %	100 %	0 %	0 %	384453061
120	NC_017291	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453061
121	NC_017291	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
122	NC_017291	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453061
123	NC_017291	A	6	6	6278	6283	100 %	0 %	0 %	0 %	384453061
124	NC_017291	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453061
125	NC_017291	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453061
126	NC_017291	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453061
127	NC_017291	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453061
128	NC_017291	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
129	NC_017291	CT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	0 %	50 %	384453061
130	NC_017291	T	6	6	6484	6489	0 %	100 %	0 %	0 %	384453061
131	NC_017291	ACA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
132	NC_017291	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453061
133	NC_017291	CAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
134	NC_017291	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	384453062
135	NC_017291	GAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453062
136	NC_017291	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453062
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399	NC_017291	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	384453069
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